药物流产虽然有不少优点，但也有它的局限性及危害，因此不能像感冒发热，自己到药房买几片APC吃那样简单，而且为了保证妇女健康，药物流产者必须在有条件的医疗机构中进行。
   药物流产的危害主要有以下几点：
   1、药流失败。药流还存在一定比例的不全流产和流产失败的可能，此时需要补服药物，或者改用人工流产，患者对此要有心理准备。临床统计显示，药流患者完全流产的比例为92%，不全流产占5%左右，流产失败占3%，为了避免药流危害的发生，广大女性做药流一定要在医院进行，切不可自行买药在家进行。
   2、出血过多。通常来说，人流手术十几分钟就结束了，而药流持续的时间比较长，所以药流出血会比人流多。严重者会因此出现贫血，甚至有因大出血而休克的患者被送来急诊。更多的女性则会在下次来月经时出血较多。当出血明显多于月经量时，患者要及时到医院就诊，可以对症使用催产素等促进子宫收缩的药物。
   3、药流较常见的危害之一是药物过敏。药流时要使用两种药，一是米非司酮，一是米索前列醇，这两种药都有令服用者过敏的情况发生。尤其是米索前列醇，过敏的人群更多，有些患者还在服用后出现了体温升高、全身发抖的情况。因此，药流一定要在医院里、医生的监护下、有抢救措施的条件下进行。